新生兒流行性腹瀉別名：新生兒傳染性腹瀉
新生兒流行性腹瀉的預防主要是消毒隔離和治療患者，以切斷感染源。一旦發現新生兒腹瀉就應立即隔離患兒和其父母，并積極治療患者。如發現流行已難避免，立即將直接或間接接觸過的嬰兒集中在一個病房，每天做大便培養，嚴密觀察腹瀉的發生。對大便培養陽性者再另集中隔離。
有作者認為凡大便培養陽性者，不論有無腹瀉都給予抗生素預防，療程5天。但也有反對藥物預防，因為藥物預防后帶菌率更高，癥狀可能推遲出現，有時還可能使癥狀反復發作，延長流行時間。
腹瀉流行的嬰兒室都應檢疫，不收新嬰兒或新病人，將已康復的嬰兒集中在一起，大便培養陰性3次后出院，未發生腹瀉的新生兒也另集中在一間，經過潛伏期(1～6天)后大便培養陰性3次后方可出院。任何病兒出院后，原床位上的用品如被褥、被單、枕頭及病床都應消毒。
嬰兒室和病室在流行期間應每天消毒，地板濕拖，家具濕揩，不讓灰塵飛揚，定時作空氣、地板、墻壁和家具拭子培養。
工作人員應特別注意手的刷洗，每接觸一患兒后應再洗手，方可接觸另一嬰兒，定時作手拭子、鼻腔拭子和大便培養，陽性者暫脫離病室或嬰兒室。喂奶前需戴消毒手套然后裝奶頭。對有糞便污染的尿布和床單需集中在一起，消毒后才可送出病室。
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